全基因组CRISPR筛选鉴定驱动耐受性树突状细胞的关键靶点

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348000

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

耐受性树突状细胞（TolDCs）对免疫耐受至关重要，并已在自身免疫性疾病的早期临床研究中展现出治疗潜力。然而，驱动其分化和耐受性表型的关键分子通路仍不明确。本研究探讨了TolDCs在响应不同耐受诱导剂时功能状态背后的分子机制，并确定CD86是耐受状态下持续且显著下调的标志物。CD86在TolDC介导的T细胞增殖和细胞因子分泌抑制中具有功能必要性，支持其作为耐受潜力替代标志物的应用。以CD86表达作为读出指标，我们进行了全基因组CRISPR-Cas9敲除筛选，并鉴定了TolDC相关表型的调控因子。该方法揭示了UBE2L6通过调控ISG15-USP18相关通路作为CD86表达的新型调控因子，提示其参与耐受性功能。这些发现确定了可用于治疗靶向的促进免疫耐受的通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。