酪氨酸羟化酶敲低的人EGFRvIII CAR T细胞体外及体内恢复后bulk RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342679

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究考察了人EGFRvIII导向的嵌合抗原受体（CAR）T细胞中酪氨酸羟化酶（TH）敲低相关的转录差异。在体外实验中，由三名健康人类供者分别独立制备供者匹配的2173-BBζ-CON-KD和2173-BBζ-TH-KD CAR T细胞产品，用EGFRvIII胞外域包被的磁珠刺激，并于第3天收集进行bulk RNA测序。在体内实验中，由同一人类供者制备上述两种CAR T细胞产品，并分别给予不同的U87-EGFRvIII荷瘤NSG-SGM3受体小鼠。CAR T细胞输注后3天，从每只小鼠脾脏中分别分选GFP阳性人CAR T细胞，每种条件三只独立受体小鼠，未进行混合。提交内容包括两项实验的双端原始测序数据和基因水平原始计数矩阵。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。