截短型RELA变异通过损害NF-κB负反馈控制驱动自身炎症和自身免疫

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE339599

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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

NF-κB信号通路协调炎症、细胞存活与增殖，同时抑制过度细胞死亡以维持免疫稳态。编码NF-κB亚基p65的RELA基因截短突变已被证实与自身炎症和自身免疫相关，但其潜在机制尚未完全阐明。我们研究了来自五个无亲缘关系家系的六例携带新型杂合RELA截短变异的患者。尽管p65表达降低，患者仍表现出广泛的炎症表现，并伴有基线及刺激诱导的促炎细胞因子升高。患者来源细胞及突变型RELA敲入模型的功能分析显示，上游NF-κB信号通路完整，但IκBα和A20等抑制性调节因子的诱导受损。这种缺陷性反馈控制使免疫稳态向炎症反应放大的方向偏移，且该偏移依赖于剩余功能性RELA等位基因的残余活性。

单细胞转录组学揭示了不同细胞类型特异性的后果：单核细胞表现出组成性I型干扰素和NF-κB激活，B细胞保留了部分代偿性信号传导，而T细胞和NK细胞则表现出细胞死亡通路的转录特征。患者成纤维细胞和突变型RELA敲入细胞进一步证实了TNF诱导的炎症基因表达增强以及对凋亡和坏死性凋亡的超敏性。这些发现确立了RELA单倍剂量不足是系统性免疫失调的一个原因，并将缺陷性NF-κB反馈控制与不受控制的炎症和炎性细胞死亡联系起来。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。