TSPO缺陷促进脓毒症后脾肿大伴髓外造血数据集

该数据集来自 NCBI GEO(GSE329160),包含小鼠盲肠结扎穿刺(CLP)脓毒症模型术后17天脾组织的 bulk RNA 测序数据,比较 sham 与 CLP 手术、TSPO 缺陷与对照

geo
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基因组分类GPL2347910090
GSE329160: Translocator Protein Deficiency Promotes Splenomegaly with Extramedullary Hematopoiesis after Sepsis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

TSPO缺陷促进脓毒症后脾肿大伴髓外造血数据集

Translocator Protein Deficiency Promotes Splenomegaly with Extramedullary Hematopoiesis after Sepsis

该数据集来自 NCBI GEO(GSE329160),包含小鼠盲肠结扎穿刺(CLP)脓毒症模型术后17天脾组织的 bulk RNA 测序数据,比较 sham 与 CLP 手术、TSPO 缺陷与对照。数据可用于分析 TSPO 缺失对脾脏红髓扩张、红系造血增强及免疫应答减弱的影响,支持基因表达与反卷积分析,探索脓毒症后脾脏免疫稳态维持机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究利用小鼠盲肠结扎穿刺(CLP)模型,探究转位蛋白(TSPO)在脓毒症后脾脏免疫应答中的作用。对 sham 或 CLP 手术后 17 天采集的脾组织进行 bulk RNA 测序,发现 TSPO 缺陷促进以红髓扩张、红系造血增强和免疫应答减弱为特征的脾肿大。基因表达和反卷积分析表明,TSPO 敲除小鼠中淋巴细胞特征减少,而成红细胞和巨核细胞特征增加。这些发现提示 TSPO 在脓毒症后维持脾脏免疫稳态中起关键作用。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL23479、10090。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329160

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 27 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究采用小鼠盲肠结扎穿刺(CLP)模型,探讨转运蛋白(TSPO)在脓毒症后脾脏免疫反应中的作用。对假手术或CLP手术后17天采集的脾脏组织进行批量RNA测序,结果显示TSPO缺陷促进脾肿大,其特征为红髓扩张、红细胞生成增强和免疫反应减弱。基因表达和去卷积分析表明,TSPO敲除小鼠中淋巴细胞特征减少,而红细胞母细胞和巨核细胞特征增加。这些发现提示TSPO在脓毒症后维持脾脏免疫稳态中发挥关键作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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