TARA队列围产期HIV感染婴儿抗逆转录病毒治疗期间PBMC纵向单细胞多组学图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE328561

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究考察了围产期感染HIV的婴儿在接受抗逆转录病毒治疗（ART）期间，免疫细胞组成、转录状态及淋巴细胞受体库的纵向变化。从TARA队列婴儿的多个时间点采集外周血单个核细胞（PBMC），时间跨度从ART开始前直至12、24及至44月龄的随访访视。采用单细胞CITE-seq（5’基因表达和表面蛋白）及V(D)J测序（BCR/TCR）对随时间变化的免疫动态进行分析。婴儿按ART的病毒学结局分层——病毒抑制者与病毒血症/未抑制者——以识别在生命早期ART期间与持久病毒抑制或持续病毒血症相关的细胞类型、基因表达程序及克隆库特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。