心房颤动心房组织单细胞水平基因表达谱

该数据集为心房颤动患者心房组织在单细胞水平上的基因表达谱,来源于 NCBI GEO(GSE322768),包含 1 个文件(GSE322768_series_matrix.txt.gz)

geo
浏览 6
基因组分类GPL232279606
GSE322768: Gene expression profile at single cell level of atrial tissue in atrial fibrillation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

心房颤动心房组织单细胞水平基因表达谱

GSE322768 是一个聚焦心房颤动心房组织在单细胞水平上基因表达谱的公开数据集,来源于 NCBI GEO 数据库,源站标题为“Gene expression profile at single cell level of atrial tissue in atrial fibrillation”。该数据集在本站归入免疫系统疾病 / 其他分类,由 Dimin,Wang 提交,发布时间为 Mar 03 202,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE322768_series_matrix.txt.gz。数据集采用高通量测序进行表达谱分析,主题标签涉及 GPL23227 平台与物种编号 9606,可用于了解心房组织在单细胞分辨率下的基因表达情况。

【数据集背景】

心房颤动是常见的心律失常之一,其发生发展与心房组织的结构重构和电重构密切相关。源站描述指出,心房组织中含有内皮细胞、肌成纤维细胞、心肌细胞和免疫细胞等多种细胞类型。要在细胞类型混杂的组织中区分不同细胞群体的表达特征,单细胞水平的基因表达谱具有重要价值。该数据集正是围绕心房颤动患者心房组织在单细胞水平上的基因表达谱而建立,主题标签中的“Expression profiling by high throughput sequencing”表明其数据来自高通量测序的表达谱分析。

【数据内容】

该数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE322768_series_matrix.txt.gz,为 GZIP 压缩格式。从源站标题与描述可知,数据内容为心房颤动心房组织在单细胞水平上的基因表达谱,涉及内皮细胞、肌成纤维细胞、心肌细胞和免疫细胞等心房组织中的细胞类型。主题标签给出了平台编号 GPL23227 和物种编号 9606。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、细胞数、基因数、测序深度等更细化的内容。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集编号为 GSE322768。作者为 Dimin,Wang,发布时间为 Mar 03 202。源站描述说明所涉及的组织为心房组织,其中包含内皮细胞、肌成纤维细胞、心肌细胞和免疫细胞。关于样本采集地点、患者纳入标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心房颤动相关的心房组织基因表达研究,尤其是需要在单细胞水平上区分内皮细胞、肌成纤维细胞、心肌细胞和免疫细胞等细胞类型表达特征的分析场景。也可用于免疫系统疾病 / 其他分类下的表达谱数据比较与方法验证。由于主题标签包含高通量测序表达谱,适合作为单细胞转录组分析流程的输入数据。具体的研究结论与生物学发现需结合数据本身分析,源站未提供相关结论。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE322768_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致分析偏差。读取后可根据平台编号 GPL23227 与物种编号 9606 进行注释与比对。源站未提供更详细的分析流程或代码。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模有限;源站未提供样本量、细胞数量、测序质量指标、批次信息及质控结果等,因此无法对数据质量作出具体评价。使用时应注意单细胞表达谱常见的稀疏性与技术噪声问题,并结合具体分析目的进行质控。此外,发布时间为 Mar 03 202,年份信息不完整,源站未提供更精确的日期说明。

【引用与许可】

引用该数据集时应注明来源 NCBI GEO 及数据集编号 GSE322768,作者为 Dimin,Wang。关于许可条款与使用限制,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE322768

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Atrial tissues contain endothelial cells, myofibroblasts, cardiomyocytes, and immune cells

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案