人眼表双能基底上皮细胞生态位驱动可塑性RNA-Seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319837

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人眼表由角膜上皮和结膜上皮组成，二者由角膜缘分隔。角膜缘是一个特化的微环境，通过角膜缘干细胞及祖细胞（LSCs）维持角膜透明性。LSC丢失或功能障碍会导致角膜缘干细胞缺乏症（LSCD），其特征为结膜化、新生血管形成、慢性炎症和角膜瘢痕形成，进而导致严重视力损害。LSCD可由损伤、自身免疫性疾病或遗传性疾病引起，但目前的治疗方法，包括角膜缘移植和体外扩增上皮移植，受限于供体可获得性和长期疗效不稳定。迄今为止，角膜缘一直被视为一个静态边界，强制维持角膜上皮与结膜上皮之间的谱系分隔。在此，我们证明人角膜缘实际上含有双潜能基底上皮祖细胞，这些细胞在转录水平上更类似于结膜基底细胞而非角膜基底细胞，其命运由局部微环境信号决定。角质形成细胞生长因子（KGF）通过FGFR2信号传导促进角膜上皮分化，而表皮生长因子（EGF）则维持结膜身份。

这种依赖于微环境的上皮可塑性为LSCD中的结膜化提供了机制解释，并确定KGF–FGFR2信号通路是角膜上皮恢复的潜在治疗靶点。总之，这些发现将角膜缘重新定义为一个动态的祖细胞微环境，对干细胞生物学和再生医学具有广泛意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。