NIK驱动髓系细胞产生IL-23是自身免疫炎症发展的关键因素 [16S rRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318004

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了NF-κB诱导激酶(NIK)在髓系细胞中于实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)发展过程中的作用。虽然发现循环髓系细胞中的NIK表达对EAE发病机制至关重要，影响T细胞致敏和IL-23产生，但我们试图确定这些效应是否由肠道微生物群的改变所介导。为验证这一点，我们对来自NIKfl/fl和NIK^CX3CR1小鼠的粪便样本进行了16S rRNA基因测序。结果显示，两种基因型之间的微生物组成无显著差异，表明所观察到的免疫表型独立于肠道微生物组的稳态变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。