流感感染中IRF3与IRF7缺陷巨噬细胞及树突状细胞的NanoString表达谱

该数据集来自 NCBI GEO(GSE313762),采用 NanoString nCounter 基因表达谱技术,对流感病毒感染过程中 IRF3 和 IRF7 缺陷的巨噬细胞与树突状细胞进行转录组分析

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL2526610090
GSE313762: NanoString profiling of IRF3 and IRF7 deficient macrophages and dendritic cells during influenza infection

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

流感感染中IRF3与IRF7缺陷巨噬细胞及树突状细胞的NanoString表达谱

NanoString profiling of IRF3 and IRF7 deficient macrophages and dendritic cells during influenza infection

该数据集来自 NCBI GEO(GSE313762),采用 NanoString nCounter 基因表达谱技术,对流感病毒感染过程中 IRF3 和 IRF7 缺陷的巨噬细胞与树突状细胞进行转录组分析。研究覆盖肺泡巨噬细胞(AM)、1 型常规树突状细胞(DC1)和 2 型常规树突状细胞(DC2),旨在系统刻画这些细胞亚型在抗病毒免疫应答中的转录变化。数据可用于比较不同基因缺陷与细胞类型间的表达差异,辅助研究干扰素调控因子在流感感染中的细胞特异性功能(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):干扰素调节因子 IRF3 和 IRF7 是抗病毒免疫应答的关键转录调控因子。然而,它们在流感病毒感染期间对巨噬细胞和树突状细胞亚型的细胞类型特异性作用仍不完全清楚。本研究采用 NanoString nCounter 基因表达谱技术,系统表征肺泡巨噬细胞(AM)、1 型常规树突状细胞(DC1)和 2 型常规树突状细胞(DC2)的转录应答。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL25266、10090。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313762

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 19 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

干扰素调节因子IRF3和IRF7是抗病毒免疫应答的关键转录调控因子。然而,它们在流感病毒感染过程中对巨噬细胞和树突状细胞亚群的特异性作用仍未完全阐明。本研究采用NanoString nCounter基因表达谱分析,系统表征了肺泡巨噬细胞(AM)、1型常规树突状细胞(DC1)和2型常规树突状细胞(DC2)的转录应答。研究分析了野生型以及IRF3或IRF7缺陷细胞在未感染和流感感染条件下的表现。该数据集可用于跨免疫细胞类型和感染状态比较分析IRF3和IRF7依赖的基因表达程序,为解析不同的抗病毒和炎症调控机制提供了资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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