GSE312827：未修饰、5-甲氧基尿嘧啶和N1-甲基假尿苷修饰RNA转染后响应细胞的RNA测序
该数据集来自NCBI GEO，对转染未修饰、m1Ψ100修饰和5moU25修饰mRNA的HepG2细胞进行转录组测序，比较不同RNA修饰引发的基因表达变化
基本信息
资源简介
GSE312827：未修饰、5-甲氧基尿嘧啶和N1-甲基假尿苷修饰RNA转染后响应细胞的RNA测序
RNA-sequencing of cells responding to transfected RNA in unmodified, 5methoxyuracil and N1 methylpsuedouridine modified RNA.
该数据集来自NCBI GEO，对转染未修饰、m1Ψ100修饰和5moU25修饰mRNA的HepG2细胞进行转录组测序，比较不同RNA修饰引发的基因表达变化。数据包含1个文件，可用于分析未修饰mRNA引起的差异表达基因、GO富集通路以及Reactome基因集富集结果，涉及干扰素和白介素产生、先天免疫应答、TLR3和RIG-I/MDA5通路激活及翻译抑制等过程，适用于研究RNA修饰对免疫应答的调控（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 08 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：HepG2细胞被转染编码eGFP报告基因的未修饰、m1Ψ100修饰和5moU25修饰的mRNA，并在24小时后进行转录组测序。针对未修饰mRNA，鉴定出超过3,500个差异表达基因（DEGs），其绝对log2foldchange大于1且校正p值<0.01，其中2,316个基因上调。对上调基因进行GO术语富集分析，鉴定出许多受调控的通路，包括预期的干扰素和白介素产生相关术语，以及先天免疫应答调节和抗病毒防御。针对Reactome术语的基因集富集分析还鉴定出特征性激活通路，包括TLR3级联反应和RIG-I/MDA5介导的应答，而受抑制的通路包括参与翻译的通路。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL34281、9606。本站分类：免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE312827
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 20 202，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE312827
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
将未修饰、m1Ψ100修饰和5moU25修饰的编码eGFP报告基因的mRNA转染至HepG2细胞，24小时后进行转录组测序。针对未修饰mRNA，共鉴定出超过3，500个差异表达基因（DEGs），筛选标准为|log2倍数变化|>1且校正p值<0.01，其中2，316个基因上调。对上调基因进行GO术语富集分析，鉴定出多个受调控的通路，包括预期的干扰素和白介素产生相关术语，以及先天免疫应答调控和抗病毒防御相关术语。针对Reactome术语的基因集富集分析还鉴定出特征性激活通路，包括TLR3级联反应和RIG-I/MDA5介导的应答，而受抑制的通路包括参与翻译的通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
