TCR-SUB1-DOCK2信号轴调控CD4+ T细胞迁移能力与自身免疫的RNA-Seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308746

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

异常活化的T细胞浸润是自身免疫发病机制的关键驱动因素，凸显了抑制T细胞迁移的治疗潜力。然而，调控抗原特异性T细胞组织进入的机制仍不清楚。在此，我们报道SUB1——一种在自身免疫疾病患者CD4+ T细胞中上调的转录因子——受TCR–IRF4轴调控。SUB1缺失使DOCK2表达降低50%，损害Rac依赖的肌动蛋白聚合和T细胞迁移，从而抑制实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的发生。机制上，SUB1通过液–液相分离（LLPS）促进Junb和Dock2基因座的染色质可及性，促进生物分子凝聚体形成。此外，SUB1直接激活Junb转录，并与JUNB协同增强Dock2表达。我们的结果确定SUB1是抗原特异性CD4+ T细胞迁移的关键调控因子，并提出其作为自身免疫疾病的有前景的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。