生殖器疱疹脱落与黏膜免疫细胞空间组织及活化改变相关数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307895

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对HSV-2血清阴性或血清阳性患者的阴道黏膜样本进行分析，并比较活动性与非活动性HSV-2排毒（肛门生殖器拭子HSV-2 PCR结果）。这一独特数据集通过空间转录组学用于定义和空间映射免疫细胞亚群及局部基因表达。单纯疱疹病毒2型（HSV-2）感染导致肛门生殖器皮肤局部病毒排毒率变化不一。偶发性病毒暴露对邻近黏膜组织（包括生殖道）免疫细胞的影响尚不清楚。然而，该部位的免疫反应可能影响保护性黏膜免疫、组织稳态及不良健康结局。为了探究HSV-2对宫颈阴道道免疫的影响，我们应用流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析及空间转录组学，对总计232名HSV-2血清阳性和血清阴性参与者提供的宫颈阴道组织和血液样本进行了研究，并在活检时评估了生殖器HSV-2排毒情况。这一独特数据集通过空间转录组学用于定义和空间映射免疫细胞亚群及局部基因表达。

单纯HSV-2血清阳性与宫颈阴道及循环T细胞表型的差异关联甚微。然而，在HSV-2活跃排毒期间，阴道黏膜与T细胞、巨噬细胞和树突状细胞的定位及基因表达变化相关，这些变化与免疫监视增强相一致，其中免疫激活和抑制信号可能共同强化黏膜组织稳态。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。