免疫调节转录因子IRF8和IRF5的共价降解剂

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304123

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转录因子是药物发现中最具挑战性的靶点之一，因为它们缺乏经典的结合口袋且高度内在无序，尽管其中许多蛋白质具有治疗重要性。IRF5和IRF8是先天免疫信号传导的关键转录调控因子，它们协调响应Toll样受体激活等刺激的促炎基因表达程序，使其成为自身免疫和炎症性疾病的核心参与者。尽管具有治疗意义，直接靶向IRF5和IRF8仍然具有挑战性。在此，我们筛选了一个半胱氨酸反应性共价配体库，以鉴定可降解IRF5的命中化合物。我们鉴定出丙烯酰胺EN1033为最佳命中化合物，它不仅以蛋白酶体依赖的方式导致IRF5丢失，还直接且共价地与IRF5蛋白结合，在巨噬细胞系中抑制IRF5特异性转录活性。然而，进一步分析后，我们发现EN1033不仅结合并降解IRF5，还更稳健且更快速地结合并降解一种相关的炎症转录因子IRF8。

我们进一步证明，EN1033通过分别共价靶向C28和C223使IRF5和IRF8失稳并降解，因为这些半胱氨酸的突变减弱了各自靶标的降解。我们还发现，IRF8的缺失导致IRF5活性下调和抑制，提示这两个转录因子之间存在交互作用，而它们均为EN1033的靶标。总体而言，我们鉴定出一种早期探索性分子，该分子共价靶向IRF8和IRF5，从而降解这些转录因子并抑制其促炎转录活性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。