饮食信号驱动的小肠T-bet表达Tr1细胞主导肠道免疫景观

数据可用于分析小肠免疫景观中该细胞群体的转录特征,探索其与饮食信号、微生物群的关系,以及作为免疫系统疾病相关研究的参考(来源 NCBI)

geo
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时间序列分类GPL3215910090
GSE298371: Gut resident T-bet expressing Tr1 cells driven by dietary signals dominate the small intestinal immune landscape I

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

饮食信号驱动的小肠T-bet表达Tr1细胞主导肠道免疫景观

Gut resident T-bet expressing Tr1 cells driven by dietary signals dominate the small intestinal immune landscape I

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE298371_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱技术(GPL32159,小鼠10090),研究饮食信号驱动的小肠固有T-bet表达Tr1细胞。数据可用于分析小肠免疫景观中该细胞群体的转录特征,探索其与饮食信号、微生物群的关系,以及作为免疫系统疾病相关研究的参考(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肠道免疫提供针对肠道病原体的防御,介导与常驻微生物群的共生关系,并提供对食物抗原的耐受性,保障该黏膜组织关键的营养吸收和屏障功能。尽管组织驻留活化T细胞数量庞大,但T细胞免疫如何贡献于这些不同作用仍知之甚少。在这里,我们描述了在小肠固有层稳态下存在的一个先前未表征的优势T-bet表达Tr1 T细胞群体。重要的是,这个分泌IL-10的CD4^+^T-bet^+^ T细胞群体在断奶时出现在小肠中,独立于常驻微生物群,在无菌条件下呈现相似的积累、功能能力和TCR库。相反,小肠T-bet^+^ Tr1 T细胞对饮食信号作出响应,驱动

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL32159、10090。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298371

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 10 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肠道免疫提供针对肠道病原体的防御,介导与常驻微生物群的共生关系,并对食物抗原提供耐受,从而保障该黏膜组织关键的营养吸收和屏障功能。尽管组织驻留的活化T细胞数量众多,但T细胞免疫如何参与这些多种作用仍知之甚少。在此,我们描述了稳态下存在于小肠固有层中的一群此前未被表征的、占主导地位的表达T-bet的Tr1 T细胞群体。重要的是,这一分泌IL-10的CD4^+^T-bet^+^ T细胞群体在断奶时出现于小肠,且不依赖于常驻微生物群,在无菌条件下表现出相似的积累、功能能力和TCR库。相反,小肠T-bet^+^ Tr1 T细胞响应饮食信号,驱动其积累、抑制性程序及克隆选择;并依赖于cDC1s、IL-27信号和T-bet,而不依赖IL-12。

总之,本研究揭示了一个此前未被充分认识的在肠道稳态免疫中起主导作用的因素,它可能在口服耐受膳食抗原过程中发挥关键的抑制作用,这对理解食物过敏和乳糜泻具有重要意义。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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