缺失tTreg或pTreg细胞时内脏脂肪组织CD4+ T细胞应答

该数据集来自NCBI GEO,利用分别选择性缺失tTreg(ΔtTreg)或pTreg(ΔpTreg)细胞发育的互补小鼠模型,从内脏脂肪组织(VAT)中FACS纯化CD4+ T细胞,并通过10x Genomics平台进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE297656: VAT CD4+ T cell responses in the absence of either tTreg or pTreg cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

缺失tTreg或pTreg细胞时内脏脂肪组织CD4+ T细胞应答

VAT CD4+ T cell responses in the absence of either tTreg or pTreg cells

该数据集来自NCBI GEO,利用分别选择性缺失tTreg(ΔtTreg)或pTreg(ΔpTreg)细胞发育的互补小鼠模型,从内脏脂肪组织(VAT)中FACS纯化CD4+ T细胞,并通过10x Genomics平台进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)。数据覆盖VAT中CD4+ T细胞亚群及TCR克隆型的高分辨率信息,可用于探究tTreg与pTreg细胞对脂肪组织稳态和炎症的差异性贡献(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Foxp3⁺调节性T(Treg)细胞是维持内脏脂肪组织(VAT)稳态的重要调节因子。由于缺乏明确的谱系标志物,胸腺来源(tTreg)和外周诱导(pTreg)亚群对VAT Treg库的相对贡献尚不清楚。为解析其作用,我们使用了分别选择性缺失tTreg(ΔtTreg)或pTreg(ΔpTreg)细胞发育的互补小鼠模型。通过FACS从这些小鼠的VAT中纯化CD4⁺ T细胞,并利用10x Genomics进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)分析。该数据集提供了VAT CD4⁺ T细胞亚群和TCR克隆型的高分辨率视图,有助于从功能上理解pTreg和tTreg细胞如何差异性地参与脂肪组织稳态和炎症。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:免疫系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297656

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 14 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Foxp3⁺调节性T(Treg)细胞是维持内脏脂肪组织(VAT)稳态的重要调节因子。由于缺乏明确的谱系标志物,胸腺来源(tTreg)与外周诱导(pTreg)亚群对VAT Treg库的相对贡献一直不清楚。为解析其作用,我们采用了分别选择性缺失tTreg(ΔtTreg)或pTreg(ΔpTreg)细胞发育的互补小鼠模型。从这些小鼠的VAT中通过FACS纯化CD4⁺ T细胞,并利用10x Genomics平台进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)分析。该数据集提供了VAT CD4⁺ T细胞亚群和TCR克隆型的高分辨率视图,有助于从功能上深入理解pTreg和tTreg细胞如何差异化地参与脂肪组织稳态与炎症。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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