重症肌无力患者与健康对照PBMC单细胞RNA测序数据集
该数据集为重症肌无力患者与健康对照者的外周血单个核细胞(PBMC)单细胞RNA测序数据,采用BD Rhapsody系统对标记后的T细胞和B细胞进行单细胞捕获

基本信息
资源简介
重症肌无力患者与健康对照PBMC单细胞RNA测序数据集
GSE297547 是一个聚焦重症肌无力(myasthenia gravis)的免疫系统疾病单细胞转录组数据集,同时纳入健康对照者作为比较对象。该数据集以外周血单个核细胞(PBMC)为样本来源,采用 BD Rhapsody 系统对标记后的 T 细胞和 B 细胞进行单细胞捕获,并通过高通量测序开展表达谱分析。数据集由 T,Tanaka 提交,于 2025 年 5 月 19 日发布,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站归类为免疫系统疾病 / 其他。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE297547_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21290 与 9606,可用于在单细胞分辨率下考察患者与对照者 PBMC 中 T、B 细胞的转录表达特征。
【数据集背景】
重症肌无力是一种累及神经肌肉接头传递的免疫相关疾病,其外周免疫细胞尤其是 T 细胞与 B 细胞的状态常被关注。该数据集以患者与健康对照者的 PBMC 为研究对象,借助单细胞 RNA 测序技术获取单个细胞的表达信息,为在细胞层面比较两组人群的免疫细胞表达谱提供数据基础。数据集的源站标题明确指向“重症肌无力患者与健康对照者的 PBMC 单细胞 RNA 测序”,本站分类将其归入免疫系统疾病 / 其他。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE297547_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。源站描述指出,研究对来自 PBMC 的 T 细胞和 B 细胞进行标记,并使用 BD Rhapsody 系统完成单细胞捕获,随后进行高通量测序的表达谱分析。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21290 和 9606,分别对应高通量测序表达谱分析、平台编号与人类物种编号。数据内容围绕患者与健康对照者 PBMC 中 T、B 细胞的单细胞转录表达展开。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 T,Tanaka,发布时间为 2025 年 5 月 19 日。样本为重症肌无力患者与健康对照者的外周血单个核细胞,实验流程为对 PBMC 中的 T 细胞和 B 细胞进行标记后,使用 BD Rhapsody 系统进行单细胞捕获。除上述信息外,样本采集地点、采集时间、伦理审批与知情同意等细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于在单细胞水平上比较重症肌无力患者与健康对照者 PBMC 中 T 细胞和 B 细胞的表达谱,可用于免疫细胞组成与转录特征的分析性研究,也可作为高通量单细胞表达谱数据的读取与处理练习对象。由于数据涉及人类物种(9606)与免疫系统疾病方向,适合免疫学、单细胞组学相关的方法学探索。具体分析结论需结合数据实际内容判断,源站未提供预设的分析结论或应用案例。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE297547_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件,读取时应关注文件内的矩阵结构与样本注释信息是否完整。源站未提供更详细的分析流程、软件参数或代码示例。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,规模信息有限;源站未提供细胞数量、测序深度、质控指标、批次信息或重复样本数量等质量相关细节。数据仅覆盖 PBMC 中标记后的 T 细胞和 B 细胞,未提及其他免疫细胞类群。发布时间为 2025 年 5 月 19 日,作者为 T,Tanaka。使用时应以实际文件内容为准,源站未提供的质量评估结论不应臆测。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款信息。使用该数据集时,应参考来源站 ncbi.nlm.nih.gov 上该数据集页面的最新说明,并遵循源站的相关使用政策。作者信息为 T,Tanaka,数据集英文名为 GSE297547: Single-cell RNA sequencing of PBMCs from patients with myasthenia gravis and healthy controls。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297547
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自PBMC的T细胞和B细胞经标记后,使用BD Rhapsody系统进行单细胞捕获处理。
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