LINC01857调控人类抗原呈递细胞存活与抗菌防御

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297509

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

巨噬细胞对于平衡病原体清除与组织稳态至关重要，然而调控这一平衡的分子调节因子仍未完全明确。在此，我们鉴定出LINC01857——一种灵长类特异性lincRNA——是巨噬细胞存活与抗菌防御的关键调节因子。LINC01857在单核细胞向巨噬细胞分化过程中被诱导，但在细菌攻击后通过NFκB迅速下调。在稳态条件下，它抑制黏附、吞噬和侵袭相关因子（包括SIGLEC1和MMP7），并抑制细胞凋亡。感染期间LINC01857的缺失形成一个“死胡同”微环境，限制鼠伤寒沙门菌的胞内复制，而强制表达则促进病原体增殖。在机制上，LINC01857与衔接蛋白14-3-3β相互作用以支持巨噬细胞存活。值得注意的是，LINC01857的下调在重症COVID-19和脓毒症患者的循环免疫细胞中同样可见。总之，我们的发现将LINC01857定位为一个连接巨噬细胞存活与宿主-病原体相互作用及疾病病理生理学的核心调节因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。