自然微生物暴露使母胎界面充满多样性T细胞

该数据集来自 NCBI GEO(GSE293451),利用 scRNAseq 比较了自然微生物暴露(与宠物店小鼠同笼饲养)孕鼠与 SPF 对照孕鼠母胎界面(胎盘与蜕膜组织)的免疫细胞组成

geo
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基因组分类GPL3432810090
GSE293451: Natural Microbial exposure populates the maternal fetal interface with diverse T cells.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

自然微生物暴露使母胎界面充满多样性T细胞

Natural Microbial exposure populates the maternal fetal interface with diverse T cells.

该数据集来自 NCBI GEO(GSE293451),利用 scRNAseq 比较了自然微生物暴露(与宠物店小鼠同笼饲养)孕鼠与 SPF 对照孕鼠母胎界面(胎盘与蜕膜组织)的免疫细胞组成。通过 Anti-CD45.2 IV 标记区分循环接触与非接触免疫细胞,并富集胎盘(IV+)与蜕膜(IV-)相关免疫细胞。数据可用于研究母体微生物负荷对母胎界面免疫格局的影响,尤其是 T 细胞群体的组成变化与扩增(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 01 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):采用 scRNAseq 研究母体微生物负荷如何影响母胎界面(MFI)的免疫学。雌性小鼠在受孕前与宠物店小鼠同笼饲养超过 4 周,并在整个妊娠期间持续同笼,以使母体免疫自然化。将同笼饲养的母鼠与无特定病原体(SPF)对照母鼠进行比较。使用 Anti-CD45.2 IV 标记技术区分组织中与循环接触的免疫细胞。IV 标记还允许在后续处理中富集胎盘(IV+)和蜕膜(IV-)组织相关免疫细胞。这是首个比较 SPF 与“脏”(宠物店同笼)母鼠 MFI(胎盘与蜕膜组织合并)免疫细胞群体的 scRNAseq 数据集。这些数据揭示了免疫细胞组成的显著变化以及 T 细胞群体的扩增,这些 T 细胞在表型上模拟了所描述的那些

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34328、10090。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE293451

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

scRNAseq用于研究母体微生物负荷如何影响母胎界面(MFI)的免疫学。雌性小鼠在受孕前与宠物店小鼠共同饲养超过4周,并在整个妊娠期间持续共居,以使母体免疫自然化。将共居母鼠与无特定病原体(SPF)对照母鼠进行比较。采用抗CD45.2静脉内(IV)标记技术,以区分组织中的免疫细胞与接触循环的免疫细胞。IV标记还允许在处理后富集胎盘(IV+)和蜕膜(IV-)组织相关免疫细胞。这是首个比较SPF母鼠与“脏”母鼠(与宠物店小鼠共居)MFI(胎盘与蜕膜组织合并)免疫细胞群体的scRNAseq数据集。这些数据揭示了免疫细胞组成的显著变化,以及T细胞群体的扩增,其表型与人类蜕膜中描述的T细胞相似。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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