GSE288492：寻常型天疱疮人原代表皮角质形成细胞模型中自身抗体的转录组响应

资源简介

GSE288492：寻常型天疱疮人原代表皮角质形成细胞模型中自身抗体的转录组响应

Transcriptome Response to Autoantibodies in Human Primary Epidermis Keratinocyte Model for Pemphgus Vulgaris

该数据集来自 NCBI GEO，研究寻常型天疱疮（PV）中靶向 DSG1/DSG3 的自身抗体在 human primary epidermis keratinocyte（HPEK）模型中的早期转录组响应。实验用 scFv PX43 与 human IgG 对照分别处理 5h、10h、24h，经 DESeq2 与通路富集分析差异表达基因及调控通路。三个时间点 PX43 相对 hIgG 的显著差异基因均少于 10 个，并富集到包括 TNFα 信号在内的炎症相关通路。数据含 1 个文件，可用于研究 PV 自身抗体结合后的早期信号事件与炎症通路变化（来源 NCBI）。

【数据集背景】

源站首次发布：Jan 31 202。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：寻常型天疱疮（PV）是一种由自身抗体（AAbs）靶向角质形成细胞上的 Desmoglein 1（DSG1）或 Desmoglein 3（DSG3）所致的自身免疫病，导致细胞间黏附破坏和表皮水疱形成。为研究 AAb 结合触发的早期信号事件，我们在用于 PV 的人原代表皮角质形成细胞（HPEK）模型中检测了转录组响应。在将靶向 DSG1 和 DSG3 的单链可变片段（scFv）PX43 与人 IgG 对照分别孵育 5h、10h 和 24h 后，使用 DESeq2 和通路富集分析对差异表达基因（DEGs）及受调控通路进行分析。在三个时间点（5h、10h 和 24h），PX43 与 hIgG 相比，在校正 p 值低于 0.05 且 |log2FC| >1 的条件下，鉴定到的显著差异表达 DEGs 很少（少于 10 个）。上调的炎症相关通路包括 TNFα 信号

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签：GPL24676、9606。本站分类：免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288492

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 10 202，引用时请注意版本时效。