人naïve-like T滤泡调节细胞分化及重症感染中紊乱的转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287876

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

调节性T细胞（Tregs）在维持免疫自身耐受和稳态中发挥关键作用。滤泡调节性T细胞（Tfr）是表达趋化因子受体CXCR5的一种特定Treg群体，已知可调节抗体产生并防止自身抗体的诱导。然而，Tfr形成的阶段仍未明确。本研究发现，人外周血中30-50%的Tfr具有初始样表型（nTfr，CD45RA+CD45RO−Foxp3+CXCR5+）。nTfr可在体外扩增，同时保留抑制能力。nTfr在离体状态下转录谱与nTreg相似，但刺激后其Tfr相关抑制分子（如IL1RA）表达增加，提示其已准备好完全分化为成熟Tfr。我们还发现nTfr具有增强的伤口愈合能力，表明该Treg亚群具有非经典功能。此外，我们证明COVID-19和脓毒症患者血液中nTfr（而非nTreg）显著减少，且这种减少与抗干扰素-γ抗体增加相关。

综合来看，这些数据表明，在重症疾病期间，Tfr细胞在其形成的最早阶段即受到干扰，并可能成为未来疫苗研发中的重要治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。