Mek1和Mek2缺失对脾脏B细胞亚群转录组的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287527

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MEK1和MEK2是ERK目前已知的唯一激活因子，作为自身免疫性疾病的治疗候选靶点颇具吸引力。研究者在Mek2杂合缺失背景（Map2k2tm1Chrn）下，利用Mek1条件性等位基因（Map2k1tm1Chrn）和Vav1-icre缺失小鼠品系（Commd10Tg(Vav1-icre)A2Kio）实现了小鼠造血细胞中Mek1的缺失。Mek1flox/flox Mek2+/- Tg+/Vav1-icre小鼠（此后称为1Mek2）因淋巴增殖性疾病而过早死亡，该疾病与自发性B细胞活化以及浆细胞、年龄相关B细胞和生发中心B细胞的积累相关（Houde, N., et al. (2022). Cell Rep 38(2): 110223）。然而，MEK信号如何精细调控免疫细胞活化目前仅被部分了解。为解决这一问题，我们应用bulk RNA-seq检测，利用1Mek2突变体来表征B细胞亚群中MEK蛋白特异性缺失所带来的转录影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。