鼻病毒通过差异参与上皮先天免疫信号触发不同宿主反应

该数据集为GSE286903,标题为鼻病毒通过差异参与上皮先天免疫信号触发不同宿主反应,属于免疫系统疾病及其他分类,来源于ncbi.nlm.nih.gov

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时间序列分类GPL246769606
GSE286903: Rhinovirus triggers distinct host responses through differential engagement of epithelial innate immune signaling

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

鼻病毒通过差异参与上皮先天免疫信号触发不同宿主反应

GSE286903 是一个聚焦于鼻病毒与上皮先天免疫信号相互作用的表达谱数据集,标题为“Rhinovirus triggers distinct host responses through differential engagement of epithelial innate immune signaling”,中文可译为“鼻病毒通过差异参与上皮先天免疫信号触发不同宿主反应”。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,在本站被归类为免疫系统疾病 / 其他。其主题标签涉及高通量测序表达谱分析,并标注了 GPL24676 平台与物种编号 9606。数据集当前提供 1 个文件,样例文件名为 GSE286903_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集适合用于了解鼻病毒感染背景下上皮细胞先天免疫信号差异参与所引发的宿主反应研究,并为相关表达谱分析提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集的源站标题为“Rhinovirus triggers distinct host responses through differential engagement of epithelial innate immune signaling”,表明其研究背景与鼻病毒感染以及上皮先天免疫信号通路相关。鼻病毒是常见的呼吸道病毒,其感染上皮细胞后可能触发不同的宿主反应,而该数据集正是围绕这一主题展开表达谱层面的记录。数据集在本站被归入免疫系统疾病 / 其他分类,说明其内容与免疫系统相关疾病研究存在关联。主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing,表明其采用高通量测序技术进行表达谱分析;GPL24676 与 9606 分别指向特定的平台与人类物种编号。作者信息为 Bao、Wang,发布时间为 Jan 14 202。源站描述仅说明“This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.”,即该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,但未进一步展开各 SubSeries 的具体内容。

【数据内容】

该数据集当前包含 1 个文件,文件样例为 GSE286903_series_matrix.txt.gz。从文件命名来看,该文件为 GZIP 压缩格式,通常用于存储系列矩阵数据。源站描述提到该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,但未提供各 SubSeries 的详细清单或具体数据表。主题标签中的 Expression profiling by high throughput sequencing 说明数据内容属于高通量测序表达谱类型;GPL24676 与 9606 分别对应平台与物种信息。除上述内容外,关于样本数量、分组方式、具体基因或转录本列表、表达量矩阵的字段结构等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 相关数据库中的记录。源站标题与数据集英文名一致,均为“Rhinovirus triggers distinct host responses through differential engagement of epithelial innate immune signaling”。作者为 Bao、Wang,发布时间为 Jan 14 202。主题标签中包含 GPL24676 与 9606,分别指向特定的检测平台与人类物种。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供更详细的采集方法、实验设计、样本来源或处理流程。关于伦理审批、知情同意、样本纳入排除标准等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与鼻病毒感染、上皮先天免疫信号以及宿主反应差异相关的表达谱分析研究。由于主题标签标明为高通量测序表达谱,并涉及人类物种编号 9606,其潜在用途包括:在生物信息学流程中作为表达谱数据输入,用于差异表达分析、通路富集分析或免疫信号相关基因集分析;也可用于方法学验证,例如在小样本上核对字段与编码后,再批量接入分析流程。本站分类为免疫系统疾病 / 其他,提示其可能用于免疫系统疾病相关的基础研究或比较分析。但具体适用的分析类型、可支持的统计比较以及生物学结论,需以实际数据内容为准;源站未提供关于适用场景的明确说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE286903_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按相应格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于源站描述仅说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,若需获取更细粒度的数据,可能需要进一步查看源站列出的 SubSeries 信息。关于读取工具、预处理步骤、归一化方法、质量控制标准以及分析参数等,源站未提供具体说明。

【质量与限制】

该数据集当前仅提供 1 个文件,文件样例为 GSE286903_series_matrix.txt.gz。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供样本量、重复数、测序深度、覆盖度、缺失值比例、批次信息或质控指标等关键质量信息。主题标签中的 GPL24676 与 9606 提供了平台与物种层面的标识,但不足以评估数据质量。发布时间为 Jan 14 202,作者为 Bao、Wang。关于数据是否存在技术偏差、生物学重复是否充分、统计效力如何以及结论的可推广性,源站未提供。因此,在使用该数据集时,应结合源站原始记录与 SubSeries 信息进行核实,避免仅凭当前描述做出超出数据支持范围的推断。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Bao、Wang,发布时间为 Jan 14 202,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站标题与数据集英文名一致,为“Rhinovirus triggers distinct host responses through differential engagement of epithelial innate immune signaling”。关于该数据集的引用格式、许可协议、使用限制、是否允许再分发或商业使用等信息,源站未提供。如需引用或使用,建议直接访问 ncbi.nlm.nih.gov 上的原始记录,查看其附带的引用要求与许可条款。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE286903

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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