健康人PBMC的SCITO-seq2超高通量单细胞转录组与表位图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE282881

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究采用SCITO-seq2平台进行了全面的单细胞转录组和表面蛋白分析，该增强型平台提高了独特转录本的回收率，同时能够实现表面蛋白的同时检测。分析分两个阶段进行：首先使用健康供者外周血单个核细胞（PBMC）验证技术性能，其次比较健康对照、儿童系统性红斑狼疮（cSLE）患者以及CTLA4单倍剂量不足伴自身免疫浸润（CHAI）患者的样本。这些结果证明了该平台在正常和疾病状态下的适用性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。