GSE281286：鉴定驱动食物免疫应答的抗原呈递细胞-T细胞相互作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281286

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肠道免疫系统必须同时耐受食物和共生菌，并防御病原体。抗原呈递细胞（APC）通过将肠腔抗原呈递给CD4+ T细胞并诱导其分化为调节性（pTreg）或炎症性（Th）亚群来协调这些免疫反应。在此，我们使用LIPSTIC来鉴定在耐受和炎症条件下呈递膳食抗原的APC。我们发现，蠕虫感染破坏耐受的程度与耐受性APC（包括迁移性cDC1和Rorγt+ APC）与炎症性APC（主要由cDC2亚群代表）之间比例的降低成正比。然而，蠕虫感染所扩增的cDC2炎症亚群并不呈递膳食抗原，从而避免了饮食特异性TH2细胞分化。我们的数据揭示了食物耐受被诱导并可被感染破坏的细胞机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。