EAE疾病高峰期脊髓浸润CD4 T细胞单细胞水平基因表达谱
该数据集来自NCBI GEO，提供EAE疾病高峰期脊髓浸润CD4 T细胞的单细胞水平基因表达谱。数据可用于免疫系统疾病中T细胞异质性及基因表达差异分析（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
EAE疾病高峰期脊髓浸润CD4 T细胞单细胞水平基因表达谱
GSE275381 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集，主题为实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）疾病高峰期脊髓浸润 CD4 T 细胞的单细胞水平基因表达谱。该数据集通过单细胞 RNA 测序，比较野生型（WT）与 G123KO 两种 CD4 T 细胞在 EAE 疾病背景下的分子差异，为研究免疫系统疾病中 T 细胞的异质性与基因表达变化提供了数据基础。数据集归类于免疫系统疾病 / 其他方向，包含 1 个数据文件，适合开展单细胞层面的差异表达与细胞亚群分析。
【数据集背景】
该数据集聚焦于 EAE 疾病模型。EAE 是免疫系统疾病研究中常用的动物模型，用于探讨自身反应性 T 细胞介导的中枢神经系统炎症。源站描述指出，研究者采用单细胞 RNA 测序技术，评估在 EAE 疾病背景下 WT 与 G123KO CD4 T 细胞之间的分子差异。数据集标题明确其研究对象为疾病高峰期浸润脊髓的 CD4 T 细胞，说明采样时间点位于疾病表现最显著的阶段，这一设计有助于捕捉炎症高峰时 T 细胞的转录状态。
【数据内容】
数据集提供的是单细胞水平的基因表达谱，属于高通量测序的表达谱分析类型。主题标签中包含 GPL24247 与 10090，分别对应芯片平台编号与物种编号（小鼠）。数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE275381_series_matrix.txt.gz，即以 GZIP 压缩的系列矩阵文本文件，通常用于承载样本层面的表达信息。源站未提供具体的细胞数量、基因数量、测序深度或表达矩阵的详细字段说明。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），作者为 Marisa、Mitchell-Flack，发布时间为 Aug 21 202（源站所载日期原文如此）。数据集英文名与源站标题一致，均为 “Gene expression profile at single cell level of spinal cord infilitrating CD4 T cells at the peak of EAE disease”。样本涉及 WT 与 G123KO 两组 CD4 T 细胞，物种为小鼠（10090）。源站未提供具体的实验流程、组织分离方法、测序平台型号细节及伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集可用于免疫系统疾病中 T 细胞异质性与基因表达差异分析，例如比较 WT 与 G123KO CD4 T 细胞在 EAE 高峰期的转录差异、识别不同细胞亚群的表达特征，以及探索与中枢神经系统炎症相关的分子变化。由于数据为单细胞水平，适合开展细胞聚类、差异表达和细胞状态注释等分析，也可作为免疫学研究中 T 细胞功能研究的参考数据。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE275381_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。源站未提供具体的读取脚本、分析参数或推荐软件。
【质量与限制】
数据集仅含 1 个文件，源站未提供样本量、细胞数、测序质量指标、批次信息及缺失值情况。发布时间字段为 “Aug 21 202”，年份信息不完整。由于缺少详细的方法学与质控说明，使用前应自行核对数据完整性与字段含义。源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可信息。使用时建议参考 NCBI GEO 的通用引用规范，并注明数据集编号 GSE275381 及作者 Marisa、Mitchell-Flack。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275381
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用单细胞RNA测序技术，评估了在EAE疾病背景下，野生型(WT)与G123KO CD4 T细胞之间的分子差异。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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