烧伤后死亡与恢复延迟相关的独特转录组特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE269523

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

严重烧伤后免疫反应失调与不良的短期和长期临床结局相关。烧伤后24小时内基因表达的关键变化已被识别，但缺乏纵向数据。因此，本研究旨在描述烧伤后前3周内的基因表达特征，并识别与不同临床结局相关的特定基因和通路。伤后4小时内就诊的患者在入院时及至第21天的设定时间点采集血液并分离RNA进行微阵列基因表达检测。在4组之间进行组间和组内比较（G1：7天内死亡；G2：7天后死亡；G3：7天后出院；G4：7天内出院）。共对116例患者的17 289个转录本进行了定量。入院时，与G4相比，G1、G2和G3分别有110、80和31个差异表达基因，且大部分不重叠。纵向组内分析也显示出不同的组别和时间依赖性模式。

在损伤后的早期时间点，与先天免疫应答和未折叠蛋白反应相关的基因和通路的上调占主导地位，而在损伤后数天至数周内，则发现凝血通路的持续上调和免疫相关通路的下调。总体而言，烧伤会引发广泛的转录组反应，在临床结局较差的患者中观察到更大且更持续的变化。这些基因表达特征揭示了损伤后立即发生的潜在分子机制，并可能在烧伤患者的诊疗中具有预后和诊断价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。