人巨细胞病毒感染人源化小鼠的单细胞RNA测序

研究以人源化小鼠为模型,对感染人巨细胞病毒(HCMV)后的样本进行单细胞 RNA 测序,用于在单细胞水平分析病毒基因与宿主基因表达的关系

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE267869: Single-cell RNA-sequencing of human cytomegalovirus-infected humanized mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

人巨细胞病毒感染人源化小鼠的单细胞RNA测序

Single-cell RNA-sequencing of human cytomegalovirus-infected humanized mice

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Single-cell RNA-sequencing of human cytomegalovirus-infected humanized mice,包含 1 个文件 GSE267869_series_matrix.txt.gz。研究以人源化小鼠为模型,对感染人巨细胞病毒(HCMV)后的样本进行单细胞 RNA 测序,用于在单细胞水平分析病毒基因与宿主基因表达的关系。HCMV 具有严格宿主特异性,人源化小鼠模型为在实验室开展 HCMV 感染研究提供了便利。该数据可用于研究 HCMV 感染与宿主免疫反应之间的相互作用,以及病毒免疫调节策略相关基因表达变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):人巨细胞病毒(HCMV)是一种常见的疱疹病毒,持续感染世界大部分人口。尽管宿主免疫反应强烈,HCMV 仍能通过发展多种免疫调节策略进行复制、逃避宿主防御并在整个生命周期中建立潜伏,这使得研究 HCMV 感染与宿主反应之间的相互作用尤为重要。HCMV 具有严格的宿主特异性,专门感染人类。因此,HCMV 的大多数体内研究依赖于临床样本。幸运的是,人源化小鼠模型的建立使得在实验室中方便地开展涉及 HCMV 感染的动物实验成为可能。单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)能够在宿主细胞内单细胞水平上研究病毒与宿主基因表达之间的关系。在本研究中,我们评估了基因表达改变

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE267869

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人巨细胞病毒(HCMV)是一种常见的疱疹病毒,可持久感染全球大部分人口。尽管宿主免疫反应强健,HCMV仍能通过发展多种免疫调节策略,实现复制、逃逸宿主防御并建立终身潜伏,这使得对HCMV感染与宿主反应相互作用的研究尤为重要。HCMV具有严格的宿主特异性,专门感染人类。因此,HCMV的大多数体内研究依赖于临床样本。幸运的是,人源化小鼠模型的建立为涉及HCMV感染的实验室动物实验提供了便利。单细胞RNA测序(scRNA-seq)使得在宿主细胞内单细胞水平上研究病毒与宿主基因表达的关系成为可能。本研究评估了感染HCMV的人源化小鼠外周血单个核细胞(PBMCs)在单细胞水平上的基因表达变化,揭示了HCMV感染人源化小鼠背景下病毒与宿主的相互作用,并为相关研究提供了宝贵的数据集。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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