SWI/SNF染色质重塑因子BAF60b通过影响调节性T细胞迁移抑制炎症性疾病 [CUT&Tag]
该数据集来自NCBI GEO,标题为SWI/SNF染色质重塑因子BAF60b通过影响调节性T细胞迁移抑制炎症性疾病,采用CUT&Tag技术进行基因组结合/占据谱分析
![GSE267296: SWI/SNF chromatin-remodeling factor BAF60b restrains inflammatory diseases by affecting regulatory T cells migration [CUT&Tag]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/161119.jpg)
基本信息
资源简介
SWI/SNF染色质重塑因子BAF60b通过影响调节性T细胞迁移抑制炎症性疾病 [CUT&Tag]
SWI/SNF chromatin-remodeling factor BAF60b restrains inflammatory diseases by affecting regulatory T cells migration [CUT&Tag]
该数据集来自NCBI GEO,标题为SWI/SNF染色质重塑因子BAF60b通过影响调节性T细胞迁移抑制炎症性疾病,采用CUT&Tag技术进行基因组结合/占据谱分析。数据包含1个文件(GSE267296_series_matrix.txt.gz),物种为小鼠(10090),平台为GPL17021。研究涉及调节性T细胞迁移的表观遗传机制,可用于分析BAF60b与RUNX1相互作用及CCR9表达调控的染色质结合特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 13 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):调节性T(Treg)细胞通过抑制过度免疫反应和维持免疫平衡,在免疫系统中发挥关键调控作用。Treg细胞的有效迁移对于控制炎症性疾病的发生和进展至关重要。然而,引导Treg细胞进入炎症组织的表观遗传机制仍未完全阐明。在本研究中,我们鉴定出BAF60b——SWI/SNF染色质重塑复合物的一个亚基——是Treg细胞迁移的正调控因子,可抑制实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)和结肠炎动物模型中的炎症进展。机制上,转录组和全基因组染色质景观分析表明,BAF60b与转录因子RUNX1相互作用,促进Treg细胞上CCR9的表达,进而影响其能
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL17021、10090。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE267296
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 02 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
调节性T(Treg)细胞通过抑制过度的免疫反应和维持免疫平衡,在免疫系统中发挥关键的调控作用。Treg细胞的有效迁移对于控制炎症性疾病的发生和进展至关重要。然而,引导Treg细胞进入炎症组织的表观遗传机制尚未完全阐明。在本研究中,我们鉴定出BAF60b——SWI/SNF染色质重塑复合物的一个亚基——是Treg细胞迁移的正向调控因子,可抑制实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)和结肠炎动物模型中的炎症进展。在机制上,转录组和全基因组染色质景观分析表明,BAF60b与转录因子RUNX1相互作用,促进Treg细胞上CCR9的表达,进而影响其向炎症组织迁移的能力。我们的工作为BAF60b在调控Treg细胞迁移中的关键作用及其对炎症性疾病的影响提供了新的见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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