GSE262467：尿嘧啶在恶性疟原虫抗原变异中的潜在作用

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262467

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

疟原虫恶性疟原虫基因组的高度多样性，是其数百年来作为极具传染性的病原体占据主导地位的关键因素。这种多样性提供了抗原变异，使寄生虫能够逃避免疫系统的识别，并促进了多重耐药虫株的迅速出现。在此，我们提出尿嘧啶——DNA中的一种非经典碱基——作为变异表面抗原多样化过程中的中介分子。我们构建了一株可诱导的PfUNG-iKO虫株，揭示了尿嘧啶碱基切除修复的必要性，这是疟原虫的一个独特特征。此外，我们专有的U-DNA-Seq技术揭示了尿嘧啶在主要变异表面抗原家族——var和rif/stevor基因家族——中呈现结构化的富集分布。这些结果表明，尿嘧啶化及其随后的切除在寄生虫生活史中发挥着关键作用。其必要性也引出了关于在DNA层面维持遗传变异的精密分子机制的问题。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。