GSE262356：包裹哺乳动物细胞的小非编码RNA驱动先天免疫

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262356

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们的研究填补了表面RNA理解上的空白，尤其是细胞外部丰富存在却缺乏精确图谱的糖基化RNA，这在稀有细胞群体中尤为突出。我们提出了AMOUR技术，它将RNA捕获与基于T7的线性扩增相结合，能够在保持质膜完整性的同时，实现对表面RNA的准确分析。通过表面荧光原位杂交和RNA适配体成像验证，证实了它们存在于外膜上，并在体外自主结合，不依赖于蛋白质支架。我们的工作揭示了非编码RNA是多种人类和小鼠造血细胞表面RNA的组成部分。对人脐带血单核细胞的单细胞测序发现，单核细胞表面普遍存在Y RNA。值得注意的是，这些Y RNA与组蛋白相互作用，在组蛋白刺激下关键性调控白细胞介素-6（IL-6）基因表达及随后的蛋白分泌。我们的发现强调了Y RNA的关键作用，阐明了它们通过捕获和呈递细胞外组蛋白参与先天免疫激活的机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。