选择性IgA缺陷与普通变异型免疫缺陷儿童调节性T细胞基因特征数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261335

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们旨在分析CVID和SIgAD患者与年龄匹配的健康对照相比，Treg细胞的基因表达谱。选择性IgA缺陷（SIgAD）是最常见的原发性抗体缺陷，而普通变异型免疫缺陷（CVID）是症状最明显的以抗体缺陷为主的形式。尽管临床表现存在差异，但提示两者具有相似的遗传背景。这两种疾病的共同特征是自身免疫性疾病的发生。调节性T细胞（Tregs）是维持自身免疫耐受的主要免疫细胞类型。由于Treg细胞的不同类型异常与原发性免疫缺陷（PID）患者的自身免疫性疾病相关，因此在本研究中，我们旨在分析CVID和SIgAD患者与年龄匹配的健康对照相比，Treg细胞的基因表达谱。使用微阵列技术进行了全转录组基因谱分析。结果，我们分析并可视化了分离的Treg细胞群体的基因和通路的全局表达模式。我们展示了伴有和不伴有自身免疫化的患者之间在基因水平上的差异。

我们的研究结果表明，从SIgAD和CVID患者中分离出的Treg细胞的基因特征与年龄匹配的健康对照组不同，且彼此之间也存在差异，而这两种PID中自身免疫的发生与IFN信号通路相关。总之，我们的发现增进了对常见PID患者中Treg功能障碍及相关自身免疫的理解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。