单细胞转录组分析揭示效应CD8+ T细胞在HIV-1感染者残留慢性免疫激活和炎症中可能发挥重要作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE254301

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管抗逆转录病毒治疗（ART）已抑制HIV-1感染患者的病毒血症并降低死亡率，但这些患者体内残留的慢性免疫激活和炎症可导致非传染性疾病风险增加，而其机制仍不明确。利用接受ART的HIV-1患者PBMC的scRNA-seq及公共可用的scRNA-seq数据，我们发现这些患者中CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、单核细胞和B细胞的比例存在差异。通过聚类分析发现，效应CD8+ T细胞在HIV感染患者和lsATR中显著减少，但在fsART中增加，迁移抑制因子（MIF）信号在fsART中显著增强。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。