GSE250579:Satb1通过抑制IL-2表达指导TH17细胞分化

该数据集来自NCBI GEO,标题为Satb1通过抑制IL-2表达指导TH17细胞分化,属于SuperSeries,由下方列出的SubSeries组成

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时间序列分类GPL1848010090
GSE250579: Satb1 directs the differentiation of TH17 cells through suppression of IL-2 expression

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE250579:Satb1通过抑制IL-2表达指导TH17细胞分化

GSE250579 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,英文标题为“Satb1 directs the differentiation of TH17 cells through suppression of IL-2 expression”,中文可译为“Satb1 通过抑制 IL-2 表达指导 TH17 细胞分化”。该数据集属于 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成,主题涉及高通量测序表达谱分析,物种信息标注为 10090(小鼠),平台编号为 GPL18480。数据集由 Joachim、Schultze 提交,发布时间为 Dec 19 202(源站记录如此)。本站将其归入免疫系统疾病 / 其他类别。数据集仅包含 1 个文件,即 GSE250579_series_matrix.txt.gz,适合关注 TH17 细胞分化调控与 IL-2 表达抑制机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集围绕 Satb1 基因在 TH17 细胞分化过程中的作用展开,标题明确指出 Satb1 通过抑制 IL-2 表达来指导 TH17 细胞的分化。TH17 细胞是一类重要的辅助性 T 细胞亚群,其分化调控涉及复杂的转录因子网络与细胞因子信号,而 IL-2 作为关键的免疫调节细胞因子,对 T 细胞的分化方向具有重要影响。该数据集以高通量测序表达谱为技术路线,为研究这一调控关系提供了转录层面的数据基础。数据集来源于 NCBI GEO,属于 SuperSeries 类型,其设计意图是将相关的 SubSeries 组织在同一系列之下,便于统一检索与引用。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件名为 GSE250579_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。从文件名判断,该文件为系列矩阵文件,通常用于汇总系列内各样本的表达数据及相关注释信息。主题标签显示其数据产生方式为“Expression profiling by high throughput sequencing”,即基于高通量测序的表达谱分析;平台编号为 GPL18480;物种编号为 10090,对应小鼠。除上述信息外,源站未提供更详细的样本数量、分组设计、测序深度或基因注释版本等内容。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站描述说明这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成。数据提交者记录为 Joachim、Schultze,发布时间为 Dec 19 202(按源站记录原样保留)。本站分类将其归入免疫系统疾病 / 其他。关于样本采集的具体组织来源、处理条件、实验批次以及测序平台的具体型号细节,源站未提供。

【适用场景】

基于标题与主题标签,该数据集可用于研究 Satb1 对 TH17 细胞分化的调控作用,特别是其通过抑制 IL-2 表达影响分化方向的机制;也可用于小鼠高通量测序表达谱的再分析、差异表达比较以及相关免疫学假设的探索。由于属于 SuperSeries,它还可作为入口定位其下属 SubSeries 的原始数据。需要说明的是,具体适用性仍取决于使用者对数据质量与实验设计的独立评估,源站未提供针对特定分析场景的验证结论。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE250579_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式解压读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于该文件为系列矩阵形式,读取时应注意区分表达值列与样本注释列,并核对平台与物种注释是否与预期一致。若需追溯原始测序数据或更细粒度的样本信息,应进一步查阅其下属 SubSeries 的记录。源站未提供具体的分析脚本、标准化方法或推荐参数。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,且为汇总性质的系列矩阵文件,可能不包含原始测序读段或完整的样本级元数据。源站描述较为简略,未提供样本数量、重复设置、质控指标等信息,因此难以仅凭现有信息评估数据的技术质量。发布时间记录为 Dec 19 202,年份信息不完整,引用时需以源站记录为准。此外,该数据集属于 SuperSeries,单独使用系列矩阵文件时可能无法覆盖全部子系列内容,分析前应确认数据范围是否满足研究需求。

【引用与许可】

引用该数据集时应注明其 GEO 编号 GSE250579 及源站标题“Satb1 directs the differentiation of TH17 cells through suppression of IL-2 expression”,并参考 NCBI GEO 的引用规范。数据提交者记录为 Joachim、Schultze。关于该数据集的具体许可条款、使用限制或再分发条件,源站未提供,使用前应查阅 NCBI GEO 的相关政策与数据条目页面。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE250579

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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