mRNA COVID-19疫苗引发强效适应性免疫应答而无SARS-CoV-2感染的急性炎症 [CV5]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE247905

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

SARS-CoV-2感染与疫苗接种能激发强烈的免疫反应。我们的研究呈现了一个全面的多模态单细胞数据集，涵盖急性COVID-19患者以及健康志愿者在接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗及加强针前后的外周血样本。通过转录谱分析结合B/T细胞受体库重建，我们对比了宿主对病毒与疫苗的免疫应答。COVID-19患者显示出增强的干扰素特征和细胞毒性基因上调，这些在疫苗接受者中并未出现。这些发现在一个独立数据集中得到了验证。B细胞和T细胞受体库分析显示，虽然COVID-19患者中大多数克隆性淋巴细胞为效应细胞，但在疫苗接受者中，循环记忆细胞的克隆扩增更为明显。此外，尽管在COVID-19患者和疫苗接受者中均观察到克隆性αβ T细胞反应，但克隆性γδT细胞的显著扩增仅在感染者中发现。我们的数据集促进了对感染与疫苗接种免疫反应的比较分析，包括克隆性B细胞和T细胞反应。

综合来看，我们的对比分析表明，疫苗接种能诱导强大的适应性免疫反应，包括持久的克隆性B细胞和T细胞反应，而不会引发与感染相关的严重炎症。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。