Mip抑制对Burkholderia pseudomallei感染J774A.1巨噬细胞免疫应答的影响

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244127

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数据说明

类鼻疽由革兰阴性细菌伯克霍尔德菌（Burkholderia pseudomallei）引起，是东南亚和澳大利亚北部的地方性流行病。其临床表现高度多样，从无症状到致死性败血症不等，因此感染结局可能取决于宿主免疫反应。本研究旨在表征在靶向毒力因子巨噬细胞感染增强蛋白（Macrophage Infectivity Potentiator，Mip）的新型抑制剂存在下，巨噬细胞对B. pseudomallei的免疫反应。为此，将鼠巨噬细胞J774A.1在两种靶向Mip蛋白的小分子抑制剂存在和不存在的情况下感染B. pseudomallei K96243。感染后四小时，通过RNA-Seq分析感染B. pseudomallei的巨噬细胞的全局转录谱。在Mip抑制剂存在下，我们发现促炎细胞因子的表达显著降低，突显了利用Mip抑制剂 dampen 巨噬细胞中B. pseudomallei感染所致潜在有害促炎反应的可能性。

随后，我们利用RNA-seq数据进行了基因表达谱分析，这些数据来自感染鼻疽伯克霍尔德菌的J774A.1巨噬细胞，在感染后4小时分别处于两种Mip抑制剂或溶剂对照的条件下。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。