SARS-CoV-2核衣壳蛋白对免疫细胞的作用及其分子机制研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236800

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探索SARS-CoV-2核衣壳蛋白（N蛋白）的免疫调节功能及其相关机制。在一系列蛋白活性实验中，SARS-CoV-2核衣壳蛋白对三种免疫细胞系（Raw264.7、Jurkat和Raji）表现出剂量依赖性的增殖促进作用。N蛋白（10μg/mL）能够显著改变这三种免疫细胞系的细胞周期进程，并可促使Raw264.7细胞迅速从S期进入G2/M期以实现快速生长。此外，N蛋白（10μg/mL）还能刺激Raw264.7细胞分泌大量促炎因子，如TNFα、IL6和IL10。RNA测序分析表明，N蛋白显著改变了免疫相关功能中某些特定基因的表达，并影响了四条重要信号通路，包括JAK-STAT信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路和MAPK信号通路，这提示N蛋白不仅能够调节免疫系统巨噬细胞中参与抵抗病毒感染过程的基因表达，还能改变细胞信号处理。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。