GSE230030:原代腹腔巨噬细胞RNA-seq比较基因表达谱分析

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE230030,包含原代小鼠腹腔巨噬细胞的RNA-seq比较基因表达谱分析数据。巨噬细胞经3%巯基乙酸盐预处理5天收集,贴壁细胞中F4/80阳性巨噬细胞占比超过90%,随后用100ng/ml重组鼠BMP9或Vehicle处理6小时以激活巨噬细胞,再进行RNA测

geo
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基因组分类GPL2845710090
GSE230030: Comparative gene expression profiling analysis of RNA-seq data for Primary peritoneal macrophages

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

GSE230030:原代腹腔巨噬细胞RNA-seq比较基因表达谱分析

Comparative gene expression profiling analysis of RNA-seq data for Primary peritoneal macrophages

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE230030,包含原代小鼠腹腔巨噬细胞的RNA-seq比较基因表达谱分析数据。巨噬细胞经3%巯基乙酸盐预处理5天收集,贴壁细胞中F4/80阳性巨噬细胞占比超过90%,随后用100ng/ml重组鼠BMP9或Vehicle处理6小时以激活巨噬细胞,再进行RNA测序。数据集仅含1个文件GSE230030_series_matrix.txt.gz,可用于研究BMP9对原代腹腔巨噬细胞转录组的影响及相关免疫调控机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 19 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):原代腹腔巨噬细胞取自经腹腔注射3%巯基乙酸盐(LA4590,Solarbio)预处理5天的小鼠腹腔渗出液。用冷PBS收集腹腔渗出细胞,调整至1×10^6细胞/ml,在DMEM中于37°C、5% CO2的细胞培养箱中培养。2小时后,用PBS洗去上清细胞,剩余贴壁细胞经流式细胞术分析含超过90%的F4+/80+巨噬细胞。腹腔巨噬细胞用100ng/ml重组鼠BMP9或Vehicle处理6小时以激活巨噬细胞。然后送RNA测序。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL28457、10090。本站分类:免疫系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE230030

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 18 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

原代腹腔巨噬细胞取自经腹腔注射3%巯基乙酸盐(LA4590,Solarbio)预处理5天的小鼠腹腔渗出液。用冷PBS收集腹腔渗出细胞,调整至1 × 10^6个细胞/ml,于DMEM中在37°C、5% CO2的细胞培养箱中培养。2小时后,用PBS洗去上清细胞,剩余贴壁细胞经流式细胞术分析显示含90%以上的F4+/80+巨噬细胞。用100ng/ml重组鼠BMP9或溶剂对照处理腹腔巨噬细胞6小时以激活巨噬细胞。随后送RNA seq,

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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