同种抗原输注选择性激活2型经典树突状细胞转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE223921

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数据说明

近期研究揭示了先天单核细胞急性识别并应答同种抗原的新分子机制，以及这一机制在同种移植物排斥和免疫耐受中的意义。目前尚不清楚的是先天同种免疫应答的单细胞异质性，尤其是树突状细胞（DC）亚群的贡献。为研究先天免疫细胞及DC亚群对同种抗原暴露的急性应答，研究者给实验啮齿动物静脉注射活同种异体细胞与同系基因细胞。同时，我们还输注了凋亡的同种异体细胞和同系基因细胞，据报道这些细胞可调节免疫。注射后48小时，收集受体脾脏，按条件合并，富集DCs，并进行单细胞mRNA测序及下游分析。与凋亡细胞注射相比，注射活脾细胞在所有DC亚群中引起了更多数量的转录变化，这一点通过差异基因表达分析得以确认。

在活细胞输注环境中，2型经典树突状细胞（cDC2s）的转录响应性更强，其中Ccr2+ cDC2亚群对同种异体抗原的存在表现出独特响应，而与同基因对照相比则无此反应。研究者对cDC2s中其他固有免疫细胞群的同种异体识别候选受体进行了探究，发现A型配对免疫球蛋白样受体（PIR-As）在同种异体暴露后特异性在cDC2群体中于mRNA水平及流式细胞术检测中均升高。这些结果揭示了治疗性输注活细胞与凋亡同种异体细胞之间此前不明确的差异，并首次将cDC2细胞与移植背景下的固有同种异体识别联系起来。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。