脓毒症免疫与预后相关lncRNA PRKCQ-AS1分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217700

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症是由感染引起的一种常见的全身炎症反应综合征，具有高死亡率和极大危害。据报道，长链非编码RNA（lncRNA）在多种疾病中发挥调控作用，是潜在的预后标志物和治疗靶点。然而，关于lncRNA对脓毒症调控作用的数据较少。因此，我们采用转录组测序及系列方法筛选和分析脓毒症中具有预后标志物潜力的lncRNA。我们收集了4例脓毒症患者全血样本和4例健康对照全血样本进行转录组测序。对原始测序数据进行质量过滤后，共获得125.581 Gb Clean Data，各样本平均数据量为15.698 Gb，Q30碱基百分比超过93.89%，GC含量在47.53%至57.54%之间。随后，我们使用HISAT2将各样本的Clean Data与人类GRCH38基因组进行比对，比对率在96.355%至97.986%之间。通过统计，我们发现获得的lncRNA分为10种类型（图1A），其中反义链（36.05%）和基因间长链非编码RNA（33.76%）为主要类型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。