GSE212721：炎症小体激活驱动化脓性汗腺炎皮肤炎症

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212721

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数据说明

治疗致衰弱性慢性皮肤病化脓性汗腺炎(HS)的手段严重不足。为设计新的治疗策略，需要更深入地了解其发病机制。尽管HS的发病率约为1/200，但人们对其认识不足且诊断率低，该病致残率高、生活质量差，且可能持续数十年。在本研究中，我们首先采用单细胞RNA测序技术，分析从HS皮损中分离的免疫细胞与健康对照皮肤相比的基因表达。我们鉴定出30个独特的免疫细胞簇，其中HS皮肤中浆细胞、Th17细胞以及一个树突状细胞(DC)亚群的频率显著富集。这些发现通过流式细胞术得到验证，结果显示HS皮肤中浸润的免疫细胞显著增加，包括T细胞、B细胞、中性粒细胞、真皮巨噬细胞和DC。测序分析表明，与健康皮肤相比，HS皮肤的免疫转录组具有独特性且异质性更大。

与Th17细胞及IL-17、IL-1β和NLRP3炎症小体相关的基因和通路在HS皮肤中增强，尤其是在炎症负荷高的样本中。炎症小体组成基因主要定位于朗格汉斯细胞和DC的一个亚群。皮肤外植体模型显示，用NLRP3炎症小体抑制剂培养HS皮肤可减少炎症反应，显著降低IL-1β和IL-17A以及其他关键炎症介质。这些数据为在HS中靶向IL-17通路提供了依据，尤其是在NLRP3炎症小体的上游。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。