GSE211560：老年人流感疫苗反应差异的免疫与分子特征预测（scRNA Seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE211560

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

季节性流感暴发造成的重大经济负担和高死亡率，尤其是在老年人等高危人群中，构成了重要的公共卫生问题。季节性疫苗（无论是传统疫苗还是针对老年人定制的疫苗）普遍效力不足，是一个关键瓶颈。因此，了解导致流感疫苗应答差异的免疫学和分子机制，是开发新型或改进型疫苗接种策略的前提。为评估老年人这一特定风险群体内部的差异，随机选取的个体（≥65岁）接种了佐剂流感疫苗Fluad®。对样本进行了单细胞转录组分析。分析揭示了根据疫苗诱导的血清转化分类，将疫苗应答者与无应答者区分开来的深刻特征。无应答者的特征是功能低下、抑制性表型，表现出较弱的体液和细胞免疫激活以及更多的抑制性调节性T细胞和B细胞。

三重应答者展现出高效的免疫功能，其特征为体液免疫和细胞免疫的激活，以及与信号通路相关基因的上调，这些通路包括抗病毒反应、蛋白质加工和B细胞活化。所生成的高维综合数据集使得能够识别出可能导致疫苗无应答的假定机制和关键节点，而不受年龄相关混杂效应的影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。