实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠引流淋巴结和脾脏中MOG反应性CD4 T细胞与对照CD4 T细胞的转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205600

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在C57BL6/N雌性小鼠皮下免疫接种用完全弗氏佐剂(CFA)乳化的MOG(35-55)后第10天，从引流淋巴结(dLN)和脾脏中分离出MOG反应性CD4 T细胞。部分小鼠接受了CpG-B-1826(50微克；TCCATgACgTTCCTgACgTT；TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH)，该物质在乳化前加入MOG(35-55)/CFA混合物中。为分离MOG反应性CD4 T细胞，在免疫后第10天从 mice 中采集dLN和脾脏，并使用MOG(35-55)(20微克/毫升)、抗CD40、抗CD28和抗CD40L-PE(均来自商业试剂盒——Miltenyi Biotec——货号130-093-129)的混合物再刺激单细胞悬液5小时。5小时后，使用抗CD4微珠(Miltenyi Biotec GmbH，货号130-049-201，克隆L3T4)通过MACS磁力富集CD4阳性细胞，随后在用抗CD4(克隆RM4-5，偶联Pacific Blue)染色后进行FACS分选，以分离CD4+CD40L+和CD4+CD40L-细胞，其中包括CD8阳性细胞的bin通道(克隆53-6.7)和死细胞染色标记(NHPO)。

随后快速检测分选得到的CD4+CD40L+和CD4+CD40L-细胞的纯度，并直接于含1%β-巯基乙醇的350微升RLT缓冲液（Invitrogen）中裂解。纯度>95%。免疫时小鼠年龄为6-10周。目的是鉴定经或未经CpG-B处理的小鼠中MOG反应性CD4 T细胞之间差异表达的基因，并表征免疫后第10天引流淋巴结和脾脏中自身反应性CD4 T细胞的转录组。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。