实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠引流淋巴结细胞转录组
该数据集为GSE205280,包含实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠引流淋巴结细胞的转录组表达谱数据,采用芯片表达谱分析,平台为GPL1261,物种为小鼠(10090)

基本信息
资源简介
实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠引流淋巴结细胞转录组
Transcriptome of cells from draining lymph nodes of mice during experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE)
该数据集为GSE205280,包含实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠引流淋巴结细胞的转录组表达谱数据,采用芯片表达谱分析,平台为GPL1261,物种为小鼠(10090)。样本覆盖naïve状态以及MOG(35-55)/CFA免疫后第1天和第3天的引流淋巴结细胞,部分小鼠在免疫混合物中添加了CpG-B-1826。数据可用于比较经典EAE免疫方案与添加CpG-B-1826后引流淋巴结细胞的差异表达基因,以无偏方式探索该处理的免疫调节效应(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 01 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):细胞制备自naïve C57BL6/N雌性小鼠的引流淋巴结(dLN),以及皮下免疫MOG(35-55)(乳化于完全弗氏佐剂(CFA)中)后第1天和第3天的C57BL6/N雌性小鼠的引流淋巴结。部分小鼠接受了CpG-B-1826(50微克;TCCATgACgTTCCTgACgTT;TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH),该成分在乳化前加入MOG(35-55)/CFA混合物中。dLN细胞直接在含1% β-巯基乙醇的350微升RLT缓冲液(Invitrogen)中裂解。免疫时小鼠年龄为6-10周。目的是鉴定经典EAE方案免疫小鼠与在免疫混合物中添加CpG-B-1826免疫小鼠的dLN细胞之间差异表达的基因,从而以无偏方法对该治疗的免疫调节效应获得一些见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205280
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 27 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
细胞制备自未免疫的C57BL6/N雌性小鼠以及皮下免疫后第1天和第3天的C57BL6/N雌性小鼠的引流淋巴结(dLN),免疫采用乳化于完全弗氏佐剂(CFA)中的MOG(35-55)。部分小鼠接受了CpG-B-1826(50微克;TCCATgACgTTCCTgACgTT;TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH),该佐剂在乳化前加入MOG(35-55)/CFA混合物中。dLN细胞直接在含1% β-巯基乙醇的350微升RLT缓冲液(Invitrogen)中裂解。免疫时小鼠年龄为6-10周。目的是鉴定经典EAE方案免疫小鼠与在免疫混合物中添加CpG-B-1826免疫小鼠的dLN细胞之间差异表达的基因,从而通过无偏倚方法对该治疗的免疫调节效应获得一些认识。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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