子宫内膜异位症类器官：子宫内膜异位病变发展的新型体外模型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202661

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数据说明

子宫内膜异位病灶的发生和发展机制尚不清楚，但免疫细胞功能障碍和炎症与子宫内膜异位症的病理生理学密切相关。缺乏合适的3D体外模型来研究细胞类型与微环境之间的相互作用是一个促进因素。为解决这一局限性，我们开发了子宫内膜异位类器官（EO），以探索上皮-基质相互作用的作用，并模拟与病灶发展相关的腹膜细胞侵袭。使用非贴壁微孔培养系统，将子宫内膜异位上皮细胞（12Z）与永生化子宫内膜异位基质细胞（iEc-ESC）或永生化子宫基质细胞（iHUF）结合，生成球形类器官。类器官自组织形成，基质细胞占据中心，上皮细胞位于类器官外周。含有iEc-ESC的子宫内膜异位类器官（EO）导致12Z上皮细胞形成复层，而与iHUF共培养时，12Z细胞形成单层上皮。

转录组分析发现，EO与12Z/iHUF类器官之间存在4,522个差异表达基因（DEG），其中排名靠前的DEG包括白细胞介素和前列腺素合酶表达的升高。EO的DEG与狒狒子宫内膜异位病灶的重叠具有高度显著性。最后，为模拟子宫内膜组织向腹膜侵袭的过程，利用EO和含人腹膜间皮细胞（LP9）的细胞外基质建立了一个模型。在雌激素或THP1来源的促炎巨噬细胞存在的情况下，EO对细胞外基质-LP9层的侵袭增加。综上所述，我们的结果有力地支持了EO是用于剖析促进子宫内膜异位病灶发展机制的合适模型这一概念。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。