GSE199532：重叠天然反义lncRNA FCER1A-AS通过促进FcεRIα表达控制过敏反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199532

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数据说明

作为高亲和力免疫球蛋白E受体（FcεRIα）的α亚基，FcεRIα在IgE介导的过敏及其他IgE相关疾病的发病机制中发挥核心作用。FcεRIα通常仅局限于嗜碱性粒细胞和肥大细胞等有限谱系的细胞中表达，但控制这些细胞中FcεRIα表达的机制尚不十分清楚。在本研究中，我们发现FcεRIα的完全重叠天然反义转录本（NATs）（FCER1A-AS）与同源正义转录本（FCER1A-S）在IL-3诱导的FcεRIα表达细胞或高表达FcεRIα的细胞系MC/9中共表达。当通过CRISPR/RfxCas13d（CasRx）方法在MC/9中选择性敲低FCER1A-AS时，FCER1A-S的mRNA和蛋白质表达也显著降低。此外，在两株不同的基因靶向小鼠品系中，发现FCER1A-AS缺陷伴随FCER1A-S表达缺失，这些小鼠的FCER1A基因座在不同位点受到干扰。更重要的是，FCER1A-AS缺陷的纯合小鼠表现出与FCER1A基因敲除小鼠相似的过敏反应减弱。

因此，我们在本研究中发现，FCER1A-S的表达受到共表达的完全重叠反义转录本的正向调控。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。