GSE196944：转录组研究揭示由人畜共患病原体创伤弧菌引起的鱼类弧菌病是一种急性炎症性疾病

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196944

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

创伤弧菌是一种与养鱼场相关的海洋人畜共患病原体，被视为气候变化的生物标志物。人畜共患菌株通过败血症迅速导致其易感宿主（鱼类或人类）死亡，这一过程在小鼠中已被证实与细胞因子风暴有关。该细菌产生的一种名为RtxA1的毒素可能在细菌入侵及随后由感染性休克导致的死亡中发挥重要作用，因为感染了rtxA1缺陷突变株的动物虽患败血症但不会死亡。本研究旨在全面分析鳗鱼血液中对创伤弧菌的早期免疫反应，以及RtxA1毒素在这一相互作用中的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。