不同瘙痒性疾病患者PBMCs比较数据集

该数据集来自NCBI GEO,标题为比较不同瘙痒性疾病患者的PBMCs。研究目的是在单细胞水平检查不同瘙痒性疾病患者循环免疫细胞群体,并与健康对照比较,以识别慢性瘙痒可能的生物标志物或治疗靶点

geo
浏览 9
基因组分类GPL246769606
GSE189188: Comparing PBMCs from patients with different pruritic conditions

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

不同瘙痒性疾病患者PBMCs比较数据集

GSE189188 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“Comparing PBMCs from patients with different pruritic conditions”,即比较不同瘙痒性疾病患者的外周血单个核细胞(PBMCs)。该研究关注慢性瘙痒这一常见且使人衰弱的多病症症状,试图在单细胞水平上检查不同瘙痒性疾病患者循环免疫细胞群体的差异,并与健康对照进行比较,以识别慢性瘙痒可能的生物标志物或治疗靶点。数据集归类于免疫系统疾病/其他,包含 1 个文件,样例文件为 GSE189188_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人(9606),平台为 GPL24676,作者为 Aaron、Ver Heul,发布时间为 Nov 19 202。

【数据集背景】

慢性瘙痒是多种疾病中均可出现的常见且使人衰弱的症状。该研究的目标是检查不同瘙痒性疾病患者循环免疫细胞群体在单细胞水平上的特征,并与健康对照进行比较,从而识别慢性瘙痒可能的生物标志物或治疗靶点。数据集标题直接体现了其核心设计:比较不同瘙痒性疾病患者的 PBMCs。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE189188_series_matrix.txt.gz。主题标签显示其属于“Expression profiling by high throughput sequencing”,涉及平台 GPL24676 和物种编号 9606。源站未提供更多关于样本数量、分组构成、基因数量或具体表达矩阵维度的信息。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 GEO 数据库,源站标题为“Comparing PBMCs from different pruritic conditions”。作者为 Aaron 和 Ver Heul,发布时间为 Nov 19 202。研究对象为不同瘙痒性疾病患者与健康对照的外周血单个核细胞。源站未提供具体的采样地点、伦理审批信息或样本采集流程细节。

【适用场景】

该数据集适用于在单细胞水平上比较不同瘙痒性疾病患者与健康对照之间循环免疫细胞群体的研究场景,可用于探索慢性瘙痒相关的候选生物标志物或治疗靶点。其表达谱数据也可用于免疫系统疾病相关的基础分析与方法学验证。源站未提供具体的下游分析案例或已验证的应用结论。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE189188_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式。建议先按文件格式读取,并在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。源站未提供具体的读取代码、标准化步骤或分析参数。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、批次效应、样本量或技术重复的具体信息。由于仅包含 1 个文件,使用时应先核对文件内容与字段编码。源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款信息。使用时建议参照 NCBI GEO 的通用引用规范,并注明数据集编号 GSE189188 及作者信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE189188

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性瘙痒是一种常见且使人衰弱的症状,可表现在多种疾病状况中。本研究旨在单细胞水平上检查来自不同瘙痒性疾病患者的循环免疫细胞群体,并将其与健康对照组进行比较,以识别慢性瘙痒可能的生物标志物或治疗靶点。

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