LPS刺激的PECs转录组分析（WT与Zc3h12a S513A）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE180028

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Regnase-1是一种内切核糖核酸酶，通过降解哺乳动物体内编码细胞因子和炎症介质的mRNA，对控制炎症至关重要。然而，在白细胞介素（IL）-1β或Toll样受体（TLR）配体刺激的细胞中，Regnase-1介导的mRNA降解如何受到调控尚不清楚。在此，通过分析Regnase-1相互作用组，我们发现IL-1β或TLR刺激可动态诱导Regnase-1与含β-转导蛋白重复序列蛋白（βTRCP）复合物的形成。重要的是，我们还在小鼠和人类细胞中发现了Regnase-1与14-3-3之间一种新的相互作用。引人注目的是，这两种相互作用以互斥方式发生，凸显了调节Regnase-1活性的重要性。此外，我们表明在IL-1R/TLR刺激的细胞中，Regnase-1与14-3-3的相互作用由IRAK1通过一个先前未表征的C端结构域介导。Regnase-1在S494和S513位点的磷酸化对Regnase-1与14-3-3的相互作用至关重要，而已知Regnase-1的另一组磷酸化位点则是βTRCP识别及蛋白酶体介导降解所必需的。

14-3-3稳定Regnase-1，但通过抑制Regnase-1与mRNA的结合来消除其活性。此外，14-3-3的相互作用阻断了Regnase-1的核质穿梭。综上所述，这些结果表明，炎症诱导的14-3-3与Regnase-1的新型相互作用通过将Regnase-1隔离在细胞质中阻止mRNA识别，从而稳定炎症mRNA。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。