牙周炎患者治疗前后及健康供者外周血单个核细胞的单细胞RNA图谱

该数据集来自NCBI GEO,包含牙周炎患者治疗前、治疗后及健康供者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序数据,共涉及4例治疗前患者、4例治疗后患者和4例健康供者

geo
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基因组分类GPL207959606
GSE174609: peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of pre- and post-treatment periodontitis patients and healthy donors by single-cell RNA profiling

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

牙周炎患者治疗前后及健康供者外周血单个核细胞的单细胞RNA图谱

peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of pre- and post-treatment periodontitis patients and healthy donors by single-cell RNA profiling

该数据集来自NCBI GEO,包含牙周炎患者治疗前、治疗后及健康供者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序数据,共涉及4例治疗前患者、4例治疗后患者和4例健康供者。牙周治疗为一日全口刮治和根面平整的全口消毒。数据可用于比较患者与健康供者免疫细胞中炎症反应相关基因的表达差异,研究牙周炎与全身疾病的关联,并识别跨细胞类型的共同代表基因(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 18 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性牙周炎导致口外共病的致病决定因素尚不清楚。本研究旨在通过治疗解决的牙周炎引发的免疫细胞分子变化,研究慢性牙周炎与全身疾病相关的主要决定因素。对4例治疗前和4例治疗后患者以及4例健康供者的外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序,以比较免疫细胞的分子和生物学差异。牙周治疗为一日全口刮治和根面平整的全口消毒。比较患者炎症反应相关基因的表达改变与治疗干预后健康供者的差异。研究了跨多种细胞类型的共同代表基因;这些基因与牙周炎-病理相关

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL20795、9606。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE174609

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 10 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

导致口外合并症的慢性牙周炎的致病决定因素尚不明确。本研究旨在通过治疗缓解的免疫细胞中牙周炎诱发的分子变化,探究与慢性牙周炎和全身性疾病相关的主要决定因素。采用外周血单核细胞进行单细胞RNA测序,比较4例治疗前和4例治疗后患者以及4名健康供者免疫细胞的分子和生物学差异。牙周治疗为一日全牙弓洁治和根面平整以实现全口消毒。将患者中炎症反应相关基因表达的改变与治疗干预后健康供者的相应表达进行比较。研究了跨多种细胞类型的共同代表性基因;这些基因与牙周炎致病菌相关的全身性疾病有关。这些在单细胞水平上将慢性牙周炎与全身炎症性疾病相关联的重要因素可能作为治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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