GSE165313：启动EAE星形胶质细胞网络的RABID转录组

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GSE165313：启动EAE星形胶质细胞网络的RABID转录组

GSE165313 数据集来源于 NCBI，标题为“RABID transcriptome from priming EAE astrocyte networks”，记录了 B6 小鼠在实验性自身免疫性脑炎（EAE）启动过程中星形胶质细胞网络的 RABID 转录组。该数据通过高通量测序进行表达谱分析，涉及平台 GPL24247 与物种编号 10090，属于免疫系统疾病相关分类。数据集由 Michael A. Wheeler 提交，发布时间为 2021 年 1 月 22 日，共包含 1 个文件，样例文件为 GSE165313_series_matrix.txt.gz。整体而言，该资源面向关注中枢神经系统炎症启动阶段星形胶质细胞网络分子特征的研究者，提供了一份可直接下载的表达谱矩阵数据。

【数据集背景】

该数据集聚焦于实验性自身免疫性脑炎（EAE）的启动阶段。EAE 是免疫系统疾病研究中常用的动物模型，用于探讨中枢神经系统炎症的发生机制。源站描述指出，该工作旨在追踪 B6 小鼠 EAE 启动过程中的星形胶质细胞网络。星形胶质细胞是中枢神经系统中的重要胶质细胞类型，其在神经炎症启动阶段的网络行为与转录组特征是该数据集关注的核心。数据集标题中的 RABID 指代所采用的转录组标记与测序策略，用于从星形胶质细胞网络中获取表达信息。

【数据内容】

数据集提供的是表达谱数据，类型为高通量测序产生的转录组表达谱。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24247 和 10090，分别对应表达谱测序、芯片/测序平台编号以及物种编号。数据文件共 1 个，样例文件名为 GSE165313_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件，通常用于承载样本层面的表达值矩阵及配套的样本注释信息。该数据集不包含原始测序读段文件的描述，源站未提供更多关于文件内部字段构成的信息。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 基因表达综合数据库（GEO）体系下的数据集条目。作者为 Michael A. Wheeler，发布时间为 2021 年 1 月 22 日。源站描述说明该数据来自 B6 小鼠 EAE 启动过程中星形胶质细胞网络的追踪研究。物种编号 10090 对应小鼠，平台编号 GPL24247 为该数据集所关联的表达谱检测平台。关于具体的实验动物数量、取材时间点、测序深度与建库细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经免疫学与胶质细胞生物学相关的研究场景，例如分析 EAE 启动阶段星形胶质细胞网络的转录组变化、比较不同样本间的表达模式，以及作为相关表达谱研究的参考数据。由于主题标签明确指向高通量测序表达谱，该数据可用于基因表达层面的二次分析。需要说明的是，源站未提供该数据集在特定分析流程或疾病机制结论上的具体应用说明，使用者应结合自身研究问题判断适用性。

【使用方法】

使用该数据集时，首先下载数据文件 GSE165313_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，需按对应格式解压后读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认数据组织方式与样本注释无误后，再进行批量接入与分析。由于数据集仅包含 1 个文件，使用流程相对直接，但源站未提供额外的预处理脚本、标准化方法或分析参数说明，使用者需自行依据表达谱矩阵的通用处理规范开展后续工作。

【质量与限制】

该数据集的文件数量为 1，样例文件为系列矩阵压缩包，源站未提供关于数据完整性、测序质量评分、批次效应或缺失值情况的说明。数据仅涉及 B6 小鼠这一物种与 GPL24247 这一平台，适用范围受此限定。源站描述较为简短，未给出样本规模、重复数及统计效力等信息，因此在解释表达差异时需谨慎。此外，发布时间为 2021 年 1 月 22 日，源站未提供后续更新记录。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Michael A. Wheeler，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的许可条款、使用限制或推荐引用格式，使用者应遵循来源站点的通用数据使用规范，并在引用时注明数据集编号 GSE165313 及其来源。